Соотношение Ingenieur, Сhargé, Directeurs de recherche

[Dushechka]

Я посмотрел по сайтам и не встретил ни в одной лаборатории одновременно
сотрудников в должностях chargé de recherche и Ingénieur de recherche

1. Такие лаборатории все же есть
2. Объяснением того, что Вы не нашли, может быть то, что часто на эти посты подают молодые люди. И редко какая лаборатория имеет шанс получить в течение котороткого промежутка времени как пост инженера, так и пост шершера.

Не могит ли эти должности по статусу совпадать и носить различное наименование в силу традиций конкретной лаборатории CNRS?

НЕТ, не могут.
Это разные должности, на получение которых проходят разные конкурсы.