Два паспорта

[Maury]

Последний раз я столкнулся с подобной проблемой когда получал новый загран паспорт в России в 2003 году.
получил новый открыл - две буквы не те! То есть, фамилия написана не так как она была написана в предыдущих паспортах и соответственно не так как она написана на французких документах.
Я немного запаниковал и рванул на обьяснение к начальнику овира.
благо мне все делали "по блату" и причина "блата" (моя хорошая знакомая) была со мной.
Так вот что мне рассказал тот важный господин из республиканского овира.
Они поменяли способ перевода фамилий, если раньше использовалась французкая транслитерация, то сейчас они перешли на английскую транслитерацию.
На границе (во всяком случае, с российской стороны) это знают.
Проблем не бывает.

допускается несовпадение в транскрипции до трех (или двух, точно не помню) знаков

Вы явно что-то путаете...
О каких особых правилах о совпадении или не совпадении вы говорите... Что с чем, должно совпадать или не совпадать?!
Транскрипция и оригинал - они разные.
Француская транскрипция и английская - в зависимости от фамилии может быть гораздо больше, чем три разные буквы. (я и у ч щ и так далее)
Скорее всего это действительно какое-то правило "отсутствия трех букв"...